荧光定量PCR检测细菌染色体上基因拷贝数

摘要：

目的建立一种以细菌染色体上1个已知拷贝管家基因作为基准、通过荧光定量PCR检测其他被检基因拷贝数的方法.方法利用荧光定量PCR检测El Tor型霍乱弧菌染色体上目的基因zot与基准基因thyA的Ct(threshold cycle)值差值,根据已知拷贝数菌株N16961的两基因Ct值之差来推算待测菌株中zot基因的拷贝数.结果利用thyA基因作参照,确定11株E1 Tor型霍乱弧菌中zot基因的拷贝数在1～5个之间,对较少拷贝数的检测与Southern blot确认的相同,对多拷贝数检测优于Southern blot的判定.结论本方法可以准确检测菌株染色体上的基因拷贝数.

关键词：荧光定量PCR、基因拷贝数、霍乱弧菌

所属期刊栏目：26

分类号：R392

资助基金：国家科技攻关项目2003BA712A05-04;科技部科研项目G1999054102

在线出版日期：2006-05-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：379-382