利用寡核苷酸芯片检测乙型肝炎病毒基因突变

摘要：

目的利用寡核苷酸芯片平行分析乙肝病毒表面抗原区S、前核心抗原pre-C区、X区、聚合酶P区12个已知的突变位点.方法针对S、pre-C、X、P区的12个突变位点,设计位于乙肝病毒反义链的24条寡核苷酸探针和两对PCR引物,探针长度为14～18bp,其5′端连有氨基己烷和T15间隔子,合成后经点样仪点到醛基化玻片上.两对PCR引物分别用于扩增S与P区内的5个突变位点和X、前C区内的7个突变位点,其中上游引物含有荧光标记.不对称PCR扩增所得到的荧光标记的单链DNA与寡核苷酸阵列杂交、清洗后经扫描分析实验结果.结果在对12个乙肝阳性样品前核心抗原C和X区的突变检测中,存在1762A→T,1764G→A联合突变的有2例、1896G→A突变的3例、同时存在1762A→T、1764G→A联合突变和1896G→A突变的1例、未存在任何突变的样品6例.在12个乙肝阳性样品的表面抗原S的突变检测中,未发现有突变出现.部分样品的随机测序结果与寡核苷酸阵列杂交结果一致.结论寡核苷酸芯片适于快速、平行、大量检测突变.

关键词：寡核苷酸芯片、乙型肝炎病毒、突变

所属期刊栏目：24

分类号：R4(临床医学)

资助基金：山东省优秀中青年科学家科研奖励基金2001CA1DAKA1

在线出版日期：2004-06-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：324-327