人巨细胞病毒UL136基因在临床低传代分离株中多态性分析

摘要：

目的研究人巨细胞病毒(human cytomegalovirus, HCMV)UL136基因在临床低传代分离株中的多态性,探讨其多态性与HCMV先天性感染不同致病性之间的关系. 方法对48株经荧光定量PCR方法检测HCMV DNA为阳性的临床低传代分离株进行HCMV UL136全序列PCR扩增,对于扩增阳性的12株PCR产物进行UL136基因全序列测定及结果分析. 结果 48株临床低传代分离株UL136 PCR扩增,12株阳性,阳性率25%,以HCMV Toledo株作为参考株,进行序列比较分析表明,12株临床分离株UL136开放阅读框架(open reading frame, ORF)长度均与Toledo株相同,为723bp,编码241个氨基酸的蛋白.DNA序列变异均为碱基替换,不同临床分离株UL136基因与Toledo株进行同源性比较,结果在核苷酸水平为97.7%～99.3%,氨基酸水平为96.6%～99.1%.UL136编码蛋白的氨基酸变异率为0.83%～3.3%.二级结构预测分为两种构象.大多数HCMV UL136蛋白翻译后修饰位点在所有分离株中均高度保守,仅几个位点在一些分离株中存在缺失或新增.Toledo株及12株临床分离株核苷酸及氨基酸序列系统进化树分析表明:45J最接近Toledo株. 结论 12株临床低传代分离株HCMV UL136基因DNA及其编码产物的氨基酸序列比较保守,但仍存在一定多态性.未发现不同临床分离株UL136基因多态性与HCMV先天性感染的表现关系.

关键词：人类巨细胞病毒、UL136基因、多态性

所属期刊栏目：23

分类号：R37(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金30170986

在线出版日期：2003-10-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：686-690