风疹病毒JR23株E1包膜糖蛋白的基因克隆与序列分析

摘要：

目的建立风疹病毒包膜糖蛋白E1的克隆载体;研究E1基因变异情况,并对其序列进行系统发生树分析.方法利用RT-PCR方法扩增并回收风疹病毒JR23株的包膜糖蛋白E1的基因片段,将其与PMD-18T载体连接,经氨苄青霉素筛选,酶切鉴定,以获得风疹病毒E1蛋白基因的克隆.将此基因测序后,利用DNASTAR和WINSTAR软件包绘制系统发生树进行序列之间的比较分析.结果筛选出含有风疹病毒E1蛋白基因的克隆.序列分析及发生树的绘制表明:JR23株与日本TCRB株及英国THOMAS株差别最小,分别为0.9%和1.2%.与北京BRD2株及香港XG379株差别最大,分别为7.6%和7.3%,与其它各株的差别均小于3%(除NC株为3.7%外),系统发生也与THO-MAS株、TCRB株最近,与BRD2株最远.结论克隆载体的建立为进一步研究E1基因与糖蛋白功能的关系提供基础.系统发生树表明中国不同地区风疹流行株基因序列存在明显差异.这对风疹病毒遗传与变异、分子流行病学研究,以及制备有效的亚单位疫苗提供了资料.

关键词：风疹病毒、E1基因、系统发生树、核酸序列分析

所属期刊栏目：22

分类号：R37(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：山东省自然科学基金Q99C10;高等院校骨干教师基金

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：660-665