10.3760/j:issn:0254-5101.2002.05.037
丙型肝炎病毒核心蛋白寡核苷酸适配子的筛选与鉴定
目的筛选、鉴定抗HCV核心蛋白(C 蛋白)的寡核苷酸适配子(aptamers). 方法利用systematic evolution of ligands by exponential enrichment (SELEX)技术,以HCV C蛋白为靶分子,从体外合成的81bp随机单链DNA文库中筛选与HCV C蛋白特异结合的寡核苷酸适配子,并进行了解离常数(Kd)测定和适配子序列测定.再分别利用Clustal W软件包和DNA Folding Sever分析适配子的一级结构和二级结构. 结果经过9轮循环筛选,随机ssDNA库与HCV C蛋白的结合率从0.5%上升到32.5%.所有的一级结构没有共同的同源序列,但可分5个家族,每个家族具有共同的保守序列.二级结构分析表明,适配子形成的茎环、凸环结构可能是与HCV C蛋白结合的结构基础.其中寡核苷酸适配子C4与HCV C蛋白特异结合的亲和力最高,Kd值为68nmol/L. 结论利用随机寡核苷酸文库成功获得抗HCV C蛋白的寡核苷酸适配子.
丙型肝炎病毒、核心蛋白、SELEX、寡核苷酸适配子
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R511(传染病)
2004-01-08(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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