宏基因二代测序在腹膜透析相关腹膜炎病原学诊断中的应用

摘要：

目的:探讨宏基因二代测序（metagenomic next-generation sequencing，mNGS）在腹膜透析（peritoneal dialysis，PD）相关腹膜炎病原学诊断中的价值。方法:该研究为回顾性队列研究。分析2020年6月至2021年7月在南京大学医学院附属鼓楼医院就诊并同时留取PD流出液样本行病原体mNGS检测和微生物培养的PD相关腹膜炎患者的临床资料，比较mNGS检测和传统微生物培养对PD相关腹膜炎病原学诊断的阳性率、时效性和一致性。结果:共18例PD相关腹膜炎患者纳入本研究，其中男性11例，女性7例，年龄（50.4±15.4）岁，中位透析龄34.0（12.4，62.0）个月。mNGS检测共有17例患者检出致病菌，阳性率为17/18，高于微生物培养的13/18，但差异无统计学意义（
P=0.219）。两种检测方法均阳性的患者有12例，其中11例患者检出的致病菌一致；5例微生物培养阴性患者的mNGS检测为阳性，包括表皮葡萄球菌3例（1例同时检出表皮葡萄球菌和人葡萄球菌）、结核分枝杆菌1例及解脲脲原体1例；1例患者微生物培养阳性（大肠埃希菌）而mNGS检测阴性。mNGS检测报告时间显著低于微生物培养［25.0（24.0，27.0）h比89.0（72.8，122.0）h，
Z=3.726，
P < 0.001］。
结论:mNGS对PD相关腹膜炎的病原体检测敏感性高，检出致病菌与微生物培养具有较好的一致性，并缩短了检出时间，可能成为PD相关腹膜炎特别是难治性腹膜炎病原体识别的新途径。

关键词：腹膜透析、腹膜炎、诊断、宏基因二代测序、病原学

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资助基金：南京市卫生科技发展专项YKK21090;南京大学医学院附属鼓楼医院临床研究专项2021-LCYJ-PY-12;Nanjing Healthcare Science and Technology Development Special Fund ProjectYKK21090;Fund for Clinical Trials from the Affiliated Drum Tower Hospital, Medical School of Nanjing University2021-LCYJ-PY-12

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：8-12