10.3760/cma.j.issn.1001-7097.2015.10.009
转化生长因子β诱导肾小球系膜细胞增生中的长链非编码RNA差异表达研究
目的 检测长链非编码RNA(lncRNA)在转化生长因子β(TGF-β)诱导的肾小球系膜细胞增生中的改变,探讨lncRNA在系膜增生性肾小球肾炎发病中的作用.方法 用TGF-β刺激建立系膜细胞增生模型.采用细胞增殖实验筛选TGF-β诱导肾小球系膜细胞增生的最佳浓度;用芯片技术筛选TGF-β刺激组与对照组有差异表达的lncRNAs;采用生物信息学分析法分析lncRNAs芯片结果,用RT-PCR法验证差异表达的lncRNAs,再根据生物信息学分析结果推测靶基因,用RT-PCR法验证.结果 细胞增殖实验结果显示,10 ng/ml TGF-β为刺激细胞增殖最佳浓度.芯片筛选结果显示,TGF-β刺激组和对照组约30 000多个lncRNAs表达,TGF-β刺激组有5550个lncRNAs差异表达于对照组,其中1 19个和147个lncRNAs上调或下调超过2倍.根据lncRNA筛选原则选取部分lncRNAs用RT-PCR法验证.结果提示:与对照组相比,TGF-β刺激组细胞uc.60、MRAK079149、MRAK029456、XR_005507、XR_007641、uc.14和uc.412的表达明显上调;BC088254、DQ402472、BC098733、BC158832、BC098746表达明显下调,与芯片检测结果一致.生物信息学分析结果显示uc.412和MRAK079149的下游靶基因分别为抗凋亡转录因子(AATF)和NimA相关激酶8(NeK8),RT-PCR验证结果提示:与对照组比较,TGF-β刺激组AATF和NEK的表达显著上调(P<0.05).结论 体外TGF-β诱导的系膜细胞增生模型中存在lncRNAs的差异表达.
肾小球系膜细胞、增生、转化生长因子β、长链非编码RNA
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R735.7;R394.2;R692.31
江苏省高等学校自然科学研究面上项目;南京市医学科技发展重点项目
2015-11-27(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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