人乳头瘤病毒16整合感染宫颈上皮细胞系恶性转化后的转录组学分析

摘要：

目的:探讨人乳头瘤病毒16(human papillomavirus type 16，HPV16)整合感染宫颈上皮细胞(H8细胞)恶性转化的相关基因、信号通路和可能机制。方法:构建H8细胞恶性转化的细胞模型，采用Transwell试验检测恶性转化后H8细胞的细胞侵袭能力、细胞迁移能力的变化，平板克隆形成实验法检测恶性转化后H8细胞克隆形成能力的变化。提取恶性转化的H8细胞、H8细胞的总RNA，采用Illumina Novaseq 6000测序平台对两组细胞进行转录组学测序，鉴定和分析差异表达基因(DEGs)，并进行基因本体(gene ontology，GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes，KEGG)通路富集分析以及蛋白互作网络分析。结果:恶性转化的H8细胞侵袭能力[(6 503±62.43)个比(298±32.19)个，
P<0.001]、迁移能力[(15 241±93.83)个比[(7 753±76.32)个，
P<0.001]，克隆形成能力[(428.3±5.03)个比[(281.3±12.10)个，
P<0.001]较H8细胞显著升高。转录组学测序结果显示，与H8细胞组相比，恶性转化的H8细胞组共有203个基因存在表达差异，其中98个上调，105个下调。GO富集分析表明DEGs主要参与了细胞内进程、生物调节和代谢过程等生物过程，KEGG分析发现主要与丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢通路、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢通路、P53信号通路、TGF-β信号通路、PI3K-Akt信号通路相关。PPI分析筛选得到DDIT3、TRIB3、ASNS等10个关键基因。
结论:与H8细胞相比，恶性转化的H8细胞在转录水平出现大量差异表达基因和通路，可进一步为恶性转化致癌的机制提供新思路，以及为预防恶性转化寻找新靶点。

关键词：RNA-seq、转录组学、人乳头瘤病毒16、恶性转化、永生化人宫颈上皮细胞

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资助基金：广东省自然科学基金2019A1515011593;广州市科技计划202102080145、202002030474;广州市临床重大技术项目2019ZD20;广州市卫生健康科技项目20211A011065;广东省医学科学研究技术基金B2023070;Guangdong Province Natural Science foundation2019A1515011593;Science and Technology Program of Guangzhou2021020801 45, 202002030474;Major Clinical Technology Projects of Guangzhou2019ZD20;Medical and Health Science Project of Guangzhou20211A011065;Medical Science and Technology Research Project of GuangdongB2023070

在线出版日期：2023-07-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：303-309