2019年上海市松江区手足口病A组肠道病毒病原特征分析
目的:了解上海市松江区2019年手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)病原中A组肠道病毒(enterovirus, EV)VP1基因特征。方法:使用实时荧光逆转录-聚合酶链式反应(reverse transcription polymerase chain reaction, RT-PCR)检测HFMD疑似病例的标本，EV阳性标本接种人横纹肌肉瘤细胞(rhabdomyosarcoma cells, RD)培养病毒。分离到的A组EV毒株经VP1区基因测序后使用MEGA X软件进行系统进化分析及核苷酸、氨基酸同源性分析。结果:2019年共检测207份HFMD标本，其中188份检出EV，柯萨奇病毒(coxsackievirus, CV)-A6、CV-A16、CV-A10、CV-A4阳性分别为47.34%(89/188)、41.49%(78/188)、3.72%(7/188)、2.66%(5/188)，其他EV阳性为4.79%(9/188)，未检出EV-A71。HFMD夏季流行高峰(5~7月)多检出B1基因亚型的CV-A16，B1a和B1b进化分支共同流行，秋冬季的次高峰(9~12月)检出D3a进化分支的CV-A6较多。CV-A10和CV-A4散在发病，均为C2基因亚型。与原型株相比，CV-A6、CV-A16、CV-A10、CV-A4 VP1基因核苷酸(氨基酸)序列同源性分别为79.22%~81.78%(95.97%~97.19%)、62.70%~65.54%(90.10%~91.30%)、81.76%~82.65%(91.63%~92.03%)、81.09%~81.79%(97.27%~97.67%)。结论:HFMD病原体流行的多样性及复杂性增加了HFMD防控难度。EV监测项目的拓展及分子流行病学的研究有助于防控HFMD。
手足口病、肠道病毒、基因型、系统进化分析、同源性
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上海市松江区公共卫生体系建设三年行动计划20GWTX01，20GWTX02;Three-year Action Plan Project of Public Health System Construction in Songjiang District of Shanghai20GWTX01, 20GWTX02
2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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