济南环境污水中肠道病毒A89型和C96型的基因特征分析

摘要：

目的:探索我国可能存在的新型肠道EV病毒(enteroviruses，EV)并研究其基因特征。方法:对济南市2018年1月和7月份的污水标本进行EVP1编码区的PCR扩增和扩增产物的下一代测序(next generation sequencing, NGS)，对发现的新型EV进行同源性分析和系统发生学分析。结果:济南1月份和7月份的污水中分别发现EV-A89型(n＝2)和EV-C96型(n＝1)核酸序列，均获得完整P1编码区序列。其中2条EV-A89序列之间存在6.1%的差异，和国内外其他分离株的VP1完整编码区同源性为88.2%~95.3%，系统进化树上与来源于新疆和其他国家的序列均没有密切的亲缘关系；所获得的EV-C96序列与国内外其他分离株的VP1核苷酸同源性为76.2%~89.4%，系统进化分析显示全球EV-C96毒株分为5个分支A~E，除1991年山东分离株外，山东株与其他国内株均位于分支D。结论:本研究丰富了新型肠道病毒EV-A89和EV-C96的分子流行病学资料，为今后开展EV-A89和EV-C96的流行趋势及其感染所致疾病的研究提供基础资料。

关键词：新型肠道病毒、环境监测、系统发生、下一代测序

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资助基金：泰山学者青年专家计划专项tsqn202103187;泰山学者工程专项ts201511105;山东省医药卫生科技发展计划202012061240;国家自然科学基金81302481;Taishan Scholar Program for Young Expertstsqn202103187;Taishan Scholar Program of Shandong Provincets201511105;Agrant from the Health Commission of Shandong Province202012061240;National Natural Science Foundation of China81302481

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：530-535