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10.3760/cma.j.cn112866-20191231-00213

2014—2018年辽宁省柯萨奇病毒A6型分离株VP1区基因特征分析

引用
目的:了解辽宁省手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)患者中分离到的柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A group 6 type, CV-A6)VP1区基因特征。方法:收集2014—2018年辽宁省14个市送检的HFMD患者非肠道病毒A组71型(enterovirus A group 71 type, EV-A71)和非柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirusA16, CV-A16)肠道病毒(enterovirus, EV)的阳性标本,通过细胞培养法分离EV,提取病毒RNA,用RT-PCR法对EV VP1区基因扩增和序列测定。利用Blast对测序结果比对后确定病毒基因型别。对鉴定为CV-A6的分离株利用软件DNAStar和MEGA5.0进行VP1区同源性分析,并构建系统进化树。结果:2014—2018年辽宁省共收到非EV-A71和非CV-A16其他EV的阳性标本7 379份,用人横纹肌瘤细胞(rhabdomyosarcoma cells, RD)分离出111株CV-A6。通过遗传进化分析显示,CV-A6流行株形成A、B、C、D分支,D分支分为D1~D3亚分支,2014—2018年43株辽宁省CV-A6分离株处在D2和D3亚分支,D2亚分支11株,D3亚分支32株。辽宁CV-A6分离株间的VP1区基因核苷酸同源性和氨基酸同源性分别为91%~100%和95.5%~100%;与处在A分支的原型株Gdula的核苷酸同源性为79%~82%,氨基酸同源性为90.9%~92.4%,亲缘关系较远;与2008年芬兰变异株KM114057共同处在D分支,亲缘关系近,核苷酸同源性为93%~96%,氨基酸同源性为93.9%~98%。结论:辽宁省CV-A6分离株有D2和D3分支共同流行传播,其中D3分支是优势流行株。

手足口病、柯萨奇病毒A组6型、基因特征

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辽宁省特色传染病病原谱流行规律研究2017ZX10103007-001;基于病毒全基因组序列溯源技术在辽宁省疾控系统的应用2017ZX10104001-005-003;Study on the Epidemic Pattern of the Characteristic Infectious Diseases in Liaoning Province2017ZX10103007-001;Application of Virus Whole Genome Sequence Tracing Technology in Disease Control System of Liaoning Province2017ZX10104001-005-003

2023-05-30(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共6页

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中华实验和临床病毒学杂志

1003-9279

11-2866/R

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2021,35(3)

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