2018—2019年辽宁省甲型流感病毒流行株HA基因进化与疫苗株匹配度分析

摘要：

目的:分析辽宁省2018—2019年甲型流感毒血凝素(hemagglutinin，HA)基因，计算并评估流行株与疫苗株的匹配度。方法:选取2018—2019年49株甲型流感毒株进行测序，对HA基因进行进化分析；研究抗原表位、糖基化位点及受体结合位点变异情况；采用
Pepitope模型对流行株与疫苗匹配度进行分析。
结果:2018—2019年流感流行季为11月份至次年3月份，主要流行型别为新甲型H1N1亚型。经进化分析，新甲型H1N1流行株属于6B.1分支，与当年疫苗株属于同一分支；季节性H3N2毒株分布在3C.2a分支上，与2018—2019年疫苗株处于同一分支，但2019—2020年疫苗株位于3C.3a分支。部分毒株在抗原表位及受体结合位点上发生了突变。若干毒株与疫苗株相比，糖基化位点发生了增加或缺失，并未出现新的糖基化位点。使用
Pepitope模型对疫苗效力从分子水平进行评估，本年度新甲型H1N1流感疫苗效力及2019—2020年疫苗株预测效力均能达到较为理想的效果。但是季节性H3N2疫苗株与本年度流行株匹配度低，计算出的疫苗效力半数以上为负值。2019—2020年H3N2亚型疫苗株效力有待进一步观察。
结论:2018—2019年辽宁省甲型H1N1流行株发生了一定程度的变异，H3N2亚型流行株与2018—2019年疫苗株匹配度低。应密切关注流行株的基因变异情况并及时更新疫苗株。

关键词：甲型流感病毒、抗原性、基因进化分析、疫苗效力

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资助基金：国家重大传染病防治科技重大专项2017ZX10103007-001;辽宁省科技厅重点实验室项目2017;辽宁省自然科学基金计划重点20170540488;Major Scientific and Technological Projects for the Prevention and Treatment of Major Infectious Diseases2017ZX10103007-001;Project of Key Laboratory of Liaoning Provincial Department of Science and Technology2017;Key Projects of Liaoning Natural Science Foundation20170540488

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：75-83