云南省蠓虫标本检出星状病毒序列
万方数据知识服务平台
应用市场
我的应用
会员HOT
万方期刊
×

点击收藏,不怕下次找不到~

@万方数据
会员HOT

期刊专题

10.3760/cma.j.cn112866-20200401-00103

云南省蠓虫标本检出星状病毒序列

引用
目的:探索云南省师宗县蠓虫携带虫媒病毒情况。方法:采用RT-PCR方法对2013年7月采集自云南省师宗县的74批3 705只蠓虫进行检测,然后对扩增条带进行克隆测序。采用DNAStar软件中MegAlign进行同源性分析,使用MEGAX软件ALIGN进行序列比对和基于Maximum Likelihood (ML)方法进行遗传进化分析。结果:在云南省采集74批蠓虫样品中3批标本(SZC33、SZC42和SZ625C8-2)扩增出600 bp左右大小电泳条带;经过对以上PCR产物直接进行测序,SZC33和SZ625C8-2样本获得西藏环状病毒序列,而SZC42样品测序失败;对SZC42样品PCR产物进行克隆,挑取5个克隆进行测序,5个克隆均获得一段长为589个核苷酸(nucleotide,nt)序列,经BLASTx比对发现这5个克隆的核苷酸序列均与美国蚊虫中发现的星状病毒样病毒(culex bastrovirus-like virus, CAVL)的非结构蛋白基因氨基酸同源性最高,遗传进化分析结果显示云南省蠓虫(SZC42)样本检测到的病毒基因序列与美国蚊虫中检测到的CAVL(NC_040647)、巴西污水中检测到的星状病毒(Astrovirus,AV)(MF042208)以及越南蝙蝠检测到的AV(NC_032426)遗传进化关系较近,但形成独立的进化分支。结论:云南省蠓虫中发现的SZC42病毒序列为星状病毒序列。

蠓虫、星状病毒、系统进化分析

34

云南省科技厅重点基金项目2019FA015;国家自然科学基金项目31660714,31460669;国家重点研发计划项目2016YFD0500303;云南省科技人才和平台计划项目2018HB046;云南省程功专家工作站202005AF150034;农业部[公益性行业(农业)科研专项]201303035;Basic Research Projects of Yunnan Province2019FA015;National Natural Science Foundation of China31660714, 31460669;National Major Research and Development Projects2016YFD0500300;Yunnan Science and Technology Talents and Platform Plan2018HB046;Yunnan Chenggong Expert Workstation202005AF150034;Chinese Special Fund for Agro-Scientific Research in the Public Interest201303035

2023-05-30(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共5页

655-659

相关文献
评论
暂无封面信息
查看本期封面目录

中华实验和临床病毒学杂志

1003-9279

11-2866/R

34

2020,34(6)

相关作者
相关机构

专业内容知识聚合服务平台

国家重点研发计划“现代服务业共性关键技术研发及应用示范”重点专项“4.8专业内容知识聚合服务技术研发与创新服务示范”

国家重点研发计划资助 课题编号:2019YFB1406304
National Key R&D Program of China Grant No. 2019YFB1406304

©天津万方数据有限公司 津ICP备20003920号-1

信息网络传播视听节目许可证 许可证号:0108284

网络出版服务许可证:(总)网出证(京)字096号

违法和不良信息举报电话:4000115888    举报邮箱:problem@wanfangdata.com.cn

举报专区:https://www.12377.cn/

客服邮箱:op@wanfangdata.com.cn