中国部分地区发热伴血小板减少综合征病毒M片段分子流行病学研究

摘要：

目的:研究中国地区发热伴血小板减少综合征病毒(severe fever with thrombocytopenia syndrome virus, SFTSV)分离株已上传至GenBank序列中M片段基本特征及该病毒的遗传和进化规律。方法:从GenBank中获取2020年6月25日前分离于中国的SFTSV毒株M片段全序，利用BioEdit软件进行多序列比对，MEGA5.0软件构建系统发生树，比较不同型别及不同来源SFTSV核苷酸和氨基酸的同源性。结果:在GenBank数据库收集到203株中国地区发热伴血小板减少综合征病毒分离株的M片段全序，其中分离于人的毒株185株，占总毒株的91.1%，分离于蜱的毒株共11株，占总毒株的5.4%，分离于其他动物如羊、鼠、刺猬的共5株，占总毒株的3.5%。系统发生树分析显示中国地区流行优势株为C2基因亚型，占总毒株的42.4%，核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为96.4%～100.0%和94 .5%～100.0%。人源毒株与动物分离株同源性极高，核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为92.5%～100.0%和92.0%～100.0%。结论:对分离自中国的发热伴血小板减少综合征病毒分离株优势株为C2型，且存在着多种型别的共循环。SFTSV可能有从C型向J型进行适应性转换的可能。

关键词：发热伴血小板减少综合征病毒、分子流行病学、系统进化分析

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资助基金：山东省传染病预防控制重点实验室开放课题2017KEYLAB02;Open Project Fund of Key Laboratory of Infectious Disease Prevention and Control in Shandong Province2017KEYLAB02

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：605-609