上海市环境污水监测埃可病毒11型基因特征和循环动态

摘要：

目的:探讨基于上海市环境污水监测中埃可病毒11型(echovirus 11, Echo11)的基因特征和循环动态变化。方法:本研究对上海市2012—2019年环境污水监测获得的Echo11分离株进行了VP1区核酸扩增和序列测定，结合上海市急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis, AFP)监测系统和健康儿童肠道病毒监测中Echo11分离株以及Echo11参考株进行序列同源性分析和系统发生学分析。结果:上海市3个监测系统来源Echo11分离株共有156株，其中2012—2019年环境污水共分离到136株，其流行高峰主要集中在夏秋季。上海市不同来源Echo11分离株进化速度较快，有40.3%存在第54位氨基酸位点突变。上海市不同来源Echo11共有5个基因亚型传播链，即A1、A2、C1、C3和D5基因亚型。2012年，环境污水、AFP病例和健康儿童之间存在A1基因亚型Echo11共循环现象。2012—2015年的优势传播链为A1基因亚型，从2016年开始，优势传播链逐渐变为D5基因亚型。结论:环境污水监测真实反映人类肠道病毒(human enterovirus, HEV)的循环状况，对于HEV相关疾病预测预警具有实际意义。

关键词：埃可病毒11型、监测、基因特征、循环

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资助基金：十三五国家传染病防治科技重大专项2017ZX10103009-003;WHO支持的国际经费项目2017/700629-0;Major National Science and Technology Projects for Prevention and Control of Infectious Diseases in the 13th Five Year Plan2017ZX10103009-003;WHO International Funding Projects2017/700629-0

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：270-275