2017年吉林省水痘-带状疱疹病毒分子特征分析

摘要：

目的 分析2017年吉林省水痘-带状疱疹病毒(varicella zoster virus,VZV)基因型别,区分疫苗株与野毒株.方法 2017年1～3月在吉林省收集到的10份疑似水痘患者的疱疹液或咽拭子样本,采用实时荧光定量PCR方法检测病毒核酸,用普通PCR扩增病毒的ORF22、ORF38和ORF62的特定区域.用ORF22的5个SNPs确定病毒株的基因型别,用ORF38和ORF62的4个SNPs区分疫苗株与野毒株.使用MEGA5和BioEdit软件分析序列结果.结果 10份疑似样本均为VZV阳性,Clade 2遗传支.其中JL17-7样本在38 048位发生了C→T的同义突变.ORF22核苷酸的亲缘性关系树分析发现,10份样本均和Clade 2代表株在同一个分支上,与Clade 2代表株的核苷酸与氨基酸同源性分别为99.5％～100％和99.3％～100％.10份样本的ORF38和ORF62的4个特异SNPs均为A-T-T-T,与野毒株一致.结论 2017年吉林省流行的VZV均属Clade 2遗传支,且均为野毒株.

关键词：水痘-带状疱疹病毒、基因型、疫苗株、野毒株

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资助基金：The Key Technology R&D Program of the National Ministry of Science 2018ZX10713-002-001-015十三五国家科技重大专项2018ZX10713-002-001-015

在线出版日期：2019-10-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：342-346