广州市男男性行为HIV-1感染者主要流行株Gp120序列变异分析

摘要：

目的 了解广州市男男性行为HIV-1主要流行株Gp120基因的序列特征.方法 收集广州市男男性行为HIV-1感染者抗病毒治疗前血浆,提取病毒RNA,反转录巢式PCR扩增获得HIV-1膜基因Gp120全长,对获得的序列进行系统进化树、长度多态性、V3环氨基酸、辅助受体预测及特征性氨基酸分析.结果 61例样本分为4个亚型,主要流行株为CRF07 BC(34/61,55.74％)和CRF01 AE亚型(24/61,39.34％).主要流行株Gp120序列长度为496～515个氨基酸,V1和V3高变区分别表现出最高和最低的长度多态性.主要流行株V3环顶端四肽的主要形式为GPGQ(56/58,96.55％),4种方法综合预测主要流行株的辅助受体主要为CCR5(50/58,86.21％).广州市男男性行为HIV-1感染者中流行的CRF01 AE亚型毒株存在4个特征性氨基酸,出现频率为0.75～0.83,CRF07 BC亚型毒株存在8个特征性氨基酸,出现频率为0.74～0.94.结论 广州市男男性行为HIV-1感染者主要流行株Gp120序列长度有着较高的多态性,V3环顶端四肽、辅助受体和特征性氨基酸有其自身特点.

关键词：人类免疫缺陷病毒1型、Gp120、V3环、特征性氨基酸

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资助基金：十三五国家科技重大专项2017ZX10202102-003-004,2018ZX10732101-001-014;国家自然科学基金委员会国际合作项目81561128007;广州市健康医疗协同创新重大专项201704020219,201803040002;Chinese National Science and Technology Major Project for the 13th Five-Year Plan2017ZX10202102-003-004,2018ZX10732101-001-014;International Collaboration Program of Natural Science Foundation of China 81561128007 , Health Care Collaborative Innovation Major Project of Guangzhou201704020219, 201803040002

在线出版日期：2019-07-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：291-296