2016-2017年安徽省诺如病毒感染的散发病例基因型别分析

摘要：

目的 分析安徽省2016-2017年诺如病毒(Norovirus,NoV)感染的散发病例基因型别分布和分子进化特征.方法 收集2016年1月至2017年12月全省哨点医院腹泻患者NoV阳性粪便标本,采用Real-time PCR检测NoV GⅠ和GⅡ基因组,选择部分阳性标本经RT-PCR扩增衣壳蛋白(VP1)区部分序列,进行核苷酸序列测定和遗传进化树分析.结果 263份NoV阳性标本中GⅡ组239份,占90.9％;GⅠ组24份,占9.1％.成功测序的55株GⅡ基因组中检出GⅡ.2、3、4/Sydney_2012、13、17、21共6个NoV GⅡ型亚型存在,其中主要的基因型为GⅡ.4/Sydney 2012,占47.27％(26/55),其次为GⅡ.17(23.64％,13/55)和GⅡ.2(14.55％,8/55),遗传进化树显示:26株GⅡ.4型间核苷酸序列同源性为97.8％～ 100％,与参考株GⅡ.4Sydney 2012(GenBank登录号:KU720515)同源性最高为98.9％.2016年NoV的优势流行株为GⅡ.17变异株,2017年的优势流行株为GⅡ.4/Sydney 2012变异株.结论 2016-2017年安徽省NoV感染性腹泻流行毒株仍以GⅡ组为主,基因亚型存在多样性,两个主要基因型更替流行.

关键词：腹泻、诺如病毒、基因型、系统进化树

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资助基金：安徽省卫生计生委科研计划项目2017jk003Scientific Research Projects of Health and Family Planning Commission of Anhui Province 2017ik003

在线出版日期：2019-06-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：136-141