2016年盐城地区麻疹病毒分子分型及血凝素蛋白基因特征分析

摘要：

目的 鉴定2016年流行于盐城地区的麻疹野病毒的基因型别,并对血凝素蛋白基因进行分子进化特征分析.方法 通过实时荧光RT-PCR方法对2016年盐城市疑似麻疹病例咽拭子标本进行核酸检测,对麻疹病毒核酸阳性标本RT-PCR扩增核蛋白、血凝素蛋白基因并测序,采用相应的生物信息软件对核苷酸及氨基酸序列比对及基因亲缘关系进化特征分析.结果 2016年盐城地区麻疹病毒经基因型分型为H1a基因亚型和D8基因型.5株H1a代表株与江西代表株(KJ136545)聚集成簇形成独立的进化小分支,属H1a-1进化基因群分支;7株D8代表株与2009年美国代表株(JN635404)聚集成簇,属D8-3-2小分支基因群毒株.与疫苗株沪S191相比,盐城地区5株H1a基因亚型代表株240位氨基酸发生了S240 N的变异,丢失了238位N-连接的糖基化位点,7株D8基因型代表株未发生N-糖基化位点的变化.结论 2016年盐城地区麻疹病毒流行株主要为中国本土H1a优势基因亚型和D8输入基因型;除5株H1a基因亚型代表株丢失了238位N-连接的糖基化位点,盐城地区12株麻疹病毒HA基因大部分重要中和抗原位点未发生变异.

关键词：麻疹病毒、基因型、HA基因、N基因、序列分析

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分类号：X52;R19

资助基金：江苏省卫计委医学青年科研课题Q201513 Medical Youth Research Project of Jiangsu Provincial Health and Family Planning Commission Q201513

在线出版日期：2018-02-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：509-514