柯萨奇病毒B组4型河南分离株VP1区基因特征分析

摘要：

目的 了解河南省手足口病病原柯萨奇病毒B组4型(CoxB4) VP1区基因特征,并比较不同疾病来源CoxB4病毒分离株VP1区异同.方法 对采集的手足口病患者临床标本134份进行RT-PCR扩增和病毒分离鉴定;通过设计CoxB4病毒VP1区特异性引物,对8株病毒进行PCR扩增,用生物学软件ATGC进行序列拼接,ClustalX1.83进行序列比对,BioEdit剪齐,MEGA4.0进行同源性分析和构建系统进化树.结果 CoxB4河南分离株VP1区长852 bp,与GenBank公布的其他分离株核苷酸相似性为80.3％ ～97.0％,氨基酸相似性96.1％～100％;与糖尿病患者分离株E2核苷酸差异最大为19.7％,与手足口病分离株差异最小为3.0％.系统进化树显示CoxB4河南分离株属于Genotype Ⅴ型,手足口病分离株与脑膜炎分离株遗传距离较近,分布在一簇中,糖尿病患者分离株在另外一簇.结论 河南地区手足口病感染CoxB4病毒存在Genotype Ⅴ型传播和流行.

关键词：CoxB4病毒、手足口病、VP1基因、系统进化树

所属期刊栏目：31

分类号：R51;R28

资助基金：河南省医学科技攻关计划省部共建项目201201003;河南省杰出青年课题164100510008 Henan Medical Science and Technology Project201201003;Henan Outstanding Youth Project164100510008

在线出版日期：2018-02-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：504-508