云南省2006-2015年狂犬病病毒核蛋白基因进化特征分析

摘要：

目的 阐明云南省2006-2015年t18株狂犬病病毒(Rabies virus,RABV)核蛋白(Nucleoprotein,N)基因进化特征及流行病学特点.方法 在云南省狂犬病流行区采集狂犬、可疑犬和病牛脑组织以及狂犬病病例脑组织、唾液和脑脊液标本,用直接免疫荧光法进行病毒抗原检测,阳性标本提取病毒核酸,通过RT-PCR扩增RABV的N基因序列并进行序列测定,用MEGA5.0软件邻接法(Neighbor-Joining)进行系统进化分析.结果 经RT-PCR和序列测定获得2012-2015年云南省91株RABV的N基因序列,并与2006-2011年获得的云南27株RABV及邻省和东南亚地区的29株RABV的N基因序列进行系统进化分析.结果表明,云南RABV进化群可分为YN-A(105株)、YN-B(6株)和YN-C(7株),并分别属于中国进化群中的China-Ⅰ、China-Ⅵ和China-Ⅱ.YN-A流行株在2006-2015年间每年均有分布,其中,2006-2011年14株,2012-2015年91株,并分布于13个州(市);YN-B和YN-C分别仅分布于2006-2010年和2008-2011年,地区分布也较为局限.YN-A和YN-C与相邻四川、贵州、广西和湖南省的China-Ⅰ或China-Ⅱ进化群流行株亲缘关系较近,YN-B与缅甸、泰国、越南和柬埔寨流行株亲缘关系较近.结论 云南省RABV存在不同传播来源的3个进化群.YN-A为优势进化群,在2006-2015年间广泛分布于云南省狂犬病流行区,并具有较强的传播速率.2012年以来云南省未再发现YN-B和YN-C进化群的流行.

关键词：狂犬病病毒、核蛋白、基因、系统进化分析

所属期刊栏目：31

分类号：S85;R51

在线出版日期：2017-11-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：424-428