2014-2015年北京顺义急性胃肠炎成年患者中诺如病毒分子进化规律分析

摘要：

目的 了解北京市顺义区急性胃肠炎成年患者中诺如病毒的感染规律及其基因特征.方法 采集2014年1月至2015年12月份北京市顺义区肠道门诊急性胃肠炎成年患者的粪便标本240份,并收集患者的流行病学资料.标本进行诺如病毒实时荧光定量PCR(Real-time PCR)检测,阳性标本应用逆转录PCR(Reverse transcription-PCR,RT-PCR)扩增诺如病毒RNA依赖性RNA聚合酶基因(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp),并进行序列测定和基因分析.结果 诺如病毒阳性检出率23.33％ (56/240),以GⅡ群为主(20.83％,50/240),GⅠ群次之(2.50％,6/240);男女阳性检出率无统计学差异(x2=0.21,P=0.65);2014-2015全年均有诺如病毒检出,高峰在11月份至次年3月份.RdRp区序列分析显示,2014年诺如病毒GⅡ.4型最多(37.50％,6/16),2015年GⅡ.17型最多(71.43％,20/28);所得的11条GⅡ.4型RdRp区序列与2009年之前的GⅡ.4型参考株不在同一个进化分枝,且同源性差异较大,而与2012年澳大利亚Sydney NSW0514株等近年参考株在同一个进化分枝,且同源性差异较小;所得的23条GⅡ.17型RdRp区序列与各GⅡ.17型参考株均位于同一进化分枝,虽然实验株与参考株的核苷酸同源性有所差异,但有氨基酸差异的只有14115和15017两株.结论 北京市顺义区急性胃肠炎成人患者中诺如病毒的主要流行基因型在2014年为GⅡ.4型,2015年转变为GⅡ.17型,且存在多种基因型共同流行的特点.

关键词：诺如病毒、急性胃肠炎、基因型

所属期刊栏目：30

分类号：S432.41;S852.659.6;R373.13

在线出版日期：2017-02-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：526-531