2013-2015年人冠状病毒OC43基因型分布特点的研究

摘要：

目的 研究人冠状病毒(Human Coronavirus,HCoV) OC43的基因型分布特点,为阐明HCoV-OC43的分子流行规律提供数据参考.方法 从2013年-2015年HCoV-OC43检测阳性的呼吸道样本中提取核酸,用逆转录方法扩增cDNA,利用特异性引物扩增全长纤突蛋白基因(S)、聚合酶基因(RdRp)和核蛋白基因(N).用Mega 6.0软件进行序列拼接、进化树构建和S蛋白氨基酸比对.结果 从16份HCoV-OC43阳性样本中获得全长S、RdRp和N基因.其中2013年的1株为D基因型,2014年的8株均为D基因型,2015年的7株中包括3株B、3株D和1株E(CH)基因型.B和D基因型的S蛋白分别有9个和16个氨基酸位点的突变与分离年份有关,B基因型中氨基酸突变呈累加现象,D基因型中出现连续突变和回复突变.结论 HCoV-OC43表现为多基因型共流行,D基因型高流行.抗原蛋白S的氨基酸突变在各基因型流行中起重要作用.本研究为完善和丰富对HCoV-OC43的分子流行特征的认识提供了数据参考.

关键词：人冠状病毒OC43、基因型、突变、流行

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资助基金：“艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治”科技重大专项2012ZX10004206;协和青年基金和中央高校基本科研业务费专项资金资助3332013127National Major Science & Technology Project for ” Control and Prevention of Major Infectious Diseases of China”2012ZX10004206;New Century Excellent Talents in University3332013127

在线出版日期：2016-06-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：175-178