北京地区急性呼吸道感染儿童RSV F蛋白抗原位点变异分析

摘要：

目的 为了解我国北京地区呼吸道合胞病毒(Respiratory Syncytial Virus RSV)融合蛋白F基因特征及抗原位点变异情况,本研究对61株RSV分离毒株F蛋白主要抗原位点区进行了基因序列分析.方法 应用RT-PCR方法分段扩增获得F蛋白主要抗原位点区基因,并对产物进行序列测定及拼接.序列比对分析,构建系统发育树,进行亲缘关系分析.结果 61株RSV分离株中,A亚型为43株,B亚型为18株.A、B亚型内核苷酸(氨基酸)同源性较高,分别为95.9％ ～ 100％(98.3％ ～ 100％)及97.5％ ～ 100％ (98.7％ ～ 100％),亚型间为83.2％ ～84.9％(93.1％ ～95.1％).基于F蛋白主要抗原位点区基因亲缘进化分析,所有分离株可分为两个主要亚群,分别对应A/B亚型;两个亚群又可分别分成6个及3个不同的进化分支.两个亚群中分别存在7个及4个氨基酸位点突变,其中抗原位点(Φ)存在209位从Q到K及211位从S到N的变异,帕利珠单抗作用的抗原位点Ⅱ存在276位从N到S的位点突变,其余突变均位于非抗原位点决定区.结论 北京地区RSV流行株与原型株相比,F蛋白存在一定的变异,但仍具有较高的核苷酸及氨基酸同源性;各抗原位点区氨基酸保守,为疫苗及相关药物研究的重要候选蛋白.

关键词：呼吸道合胞病毒、F蛋白、抗原位点、变异、帕利珠单抗

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资助基金：艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治科技重大专项北京地区儿童呼吸道感染样本病原学的研究2012ZX10004206-004;国家呼吸疾病临床医学中心课题全国多中心儿童社区获得性肺炎的诊治研究2013BAI09B11;北京市优秀人才培养资助项目2014000021469G237

在线出版日期：2015-11-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

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