博卡病毒2基因突变对蛋白三级结构及其进化关系的影响

摘要：

目的 了解人类博卡病毒2(HBoV2)基因突变对重要功能蛋白三级结够及其进化关系的影响.方法 对瑞安地区205份小儿腹泻患者粪便标本进行HBoV2基因筛选.选取阳性样本,采用巢式PCR方法对HBoV2全基因组扩增.通过Swiss-PdbViewer对预测蛋白结构进行分析,并采用MEGA5.1软件进行进化树分析.结果 瑞安地区HBoV2阳性检出率为5.36％ (11/205).HBoV2全基因组经过拼接后为5196 bases,与参考基因组同源性达到99.79％.其中,NP1基因未发生突变,NS1、VP1和VP2基因存在有义突变.NS1测序组和对照组蛋白表面突变氨基酸疏水性质发生变化;VP1测序组和对照组蛋白空间结构和分子内部氢键分布发生变化.系统进化树分析显示,HBoV2中NSl突变造成亲缘关系变化,突变后NS1有向HBoV4演化趋势.结论 研究证明瑞安地区小儿腹泻患者存在HBoV2感染,且阳性样本中HBoV2基因发生突变.有义突变造成重要蛋白空间结构和亲缘关系变化.这些结果对研究HBoV2病毒突变后的进化方向奠定基础.

关键词：博卡病毒、人、腹泻、突变、蛋白质结构、三级、进化

所属期刊栏目：29

分类号：Q51;R329;R725.7

在线出版日期：2015-05-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：133-135