吉林省2009-2011年柯萨奇病毒A组16型基因亲缘关系研究

摘要：

目的 分析致吉林省2009-2011年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)流行的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus group A type 16,CA16)分离株的基因亲缘关系.方法 对吉林省2009-2011年分离获得的54株CA16分离株的VP1编码区基因进行逆转录-聚合酶链反应扩增以及基因序列测定,使用MEGA 4.0软件进行基因亲缘关系分析.结果 吉林省2009-2011年54株CA16分离株有28株属于B1a基因亚型,26株属于B1b基因亚型;2009-2011年每年B1a基因亚型所占比例分别为86.7％、47.1％、31.8％,B1b基因亚型所占比例分别为13.3％、52.9％、68.2％.28株B1a基因亚型CA16形成了一个优势传播链和一个小传播链,26株B1b基因亚型CA16形成了一个优势传播链和两个小传播链.结论 B1a基因亚型所占比例呈现逐年下降趋势,B1b基因亚型所占比例呈现逐年增加趋势.吉林省2009-2011年呈现两个基因亚型各有一个优势传播链为主、各有1～2个小传播链为辅的共流行传播模式.

关键词：柯萨奇病毒感染、基因

所属期刊栏目：28

分类号：R512.91;R373.2;R737.33

资助基金：艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治"科技重大专项传染病监测技术平台项目2012ZX10004209-003

在线出版日期：2014-09-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：249-251