我国甲型肝炎病毒BJ73株全基因组测定与分析

摘要：

目的 从北京地区一例急性期甲肝患者血清中提取甲肝病毒核酸,获得一株甲肝病毒(HAV)全基因组序列,进行相关分析.方法 分8段设计16对重叠基因片段引物,经提取病毒RNA、反转录、巢式PCR扩增及产物直接测序获得序列.结果 获得的BJ73全基因组核苷酸全长7477 bp,编码含2227个氨基酸的多聚蛋白;同源比对发现BJ73核苷酸和氨基酸序列均与LU38同源性最高,分别为99.1％和99.7％;VP3-VP1区域内已发表的抗原中和位点处未发现氨基酸变异;分别基于全基因序列和不同区段序列构建系统进化树,均表明B J73病毒株属于IA亚型;选择压力分析表明全编码区处于负向选择.结论 本实验得到的相关数据为我国甲肝病毒基因型分布、病毒进化等研究提供了依据和实验基础.

关键词：肝炎病毒,甲型、基因、序列分析

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资助基金：国家高技术研究发展计划863计划2011AA02A114

在线出版日期：2014-05-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：105-107