汉坦病毒浙江分离株的基因分型

摘要：

目的 对浙江省汉坦病毒(HV)分离株进行基因分型,为制定肾综合征出血热防制对策提供科学依据.方法 应用RT-PCR的方法,使用汉坦病毒型特异性引物,对汉坦病毒浙江分离株型特异性M和S片段进行扩增和测序,并与其他已知病毒序列进行比较,以明确浙江株的基因型和亚型.结果 本研究中18株HV浙江株11株为汉滩型(HTN),分为5个亚型,另7株为汉城型(SEO),分为3个亚型.HTNV ZNB-1、ZNB-2毒株和A3毒株以及SEOV Gou3、ZJ5毒株在种系发生上与其他HTNV和SEOV明显不同,Gou3和ZJ5株在SEOV发生群中构成一独立分支,比较核苷酸序列发现,ZNB-1和ZNB-2病毒M片段除与HTNV Nc167株有较高的同源性外(88.7％),与其他HTNV的同源性在69.7％ ～74.0％之间,A3株M片段除与HTNV B78株有较高的同源性外(99.7％),与其他HTNV的同源性在73.6％ ～76.3％之间.结论 浙江省是汉坦病毒中汉滩型和汉城型的混合型疫区,HTNV至少有5个亚型,SEOV至少有3个亚型,而且浙江省存在着特殊亚型的HTN毒株以及SEO毒株.

关键词：汉坦病毒、基因型

所属期刊栏目：26

分类号：R512.8;R373.3;R184.35

资助基金：国家自然科学基金;浙江省自然科学基金;江苏省自然科学基金

在线出版日期：2013-01-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：344-347