应用鼻咽癌家系资料评估HLA三座位单倍型软件推算方法的研究

摘要：

目的 通过家系资料,对比分析不同统计学单倍型推算方法在HLA-A-B-C三基因座位单倍型推算运用中的准确性及有效性.方法 选择558例有完整家系资料的个体,通过SAS/Genetics、Arlequin遗传学分析软件的EM算法、ELB算法分别进行单倍体确认,计算个体单倍型频率,并与家系分析结果相比较.结果 558例研究个体中,SAS/Genetics、Arlequin遗传学分析软件的EM算法、ELB算法分别估算得到248、247和238种单倍型,推算准确率分别为88.5％、89.1％,90.3％.3种软件推算方法得到的单倍型推算准确性、最常见单倍型分布差异无统计学意义.结论 运用统计学推算软件进行群体数据的单倍型推算可获得较高的准确性,3种算法得到的常见单倍型频率差异无统计学意义.但总体来说,ELB算法更加准确.

关键词：白细胞抗原、鼻肿瘤、单倍性、统计学

所属期刊栏目：26

分类号：R392.11

资助基金：广西科技计划项目114003A-49;美国国立卫生院国立癌症研究所资助项目NO1-CO-12400;梧州市科技计划项目201102062

在线出版日期：2012-11-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：288-290