苏州市甲型H1N1流感病毒HA基因的分子演变和遗传特征分析

摘要：

目的 对新型H1N1从2009年在苏州出现至2011年度基本消失整个过程中,苏州分离株血凝素( haemagglutinin,HA)基因的变化和分子特征进行了分析.方法 提取苏州分离株的RNA,以WHO推荐的引物扩增HA基因并测序.采用生物信息学软件对苏州毒株的HA进行详细的分子特征分析,并与疫苗株及全球和全国的代表性毒株进行比对分析.结果 与疫苗株相比,5株苏州株的核苷酸序列同源性在98.8％ ～99.4％之间,氨基酸序列同源性在98.8％～99.4％之间.5株苏州株中3株在1个抗原位点突变,2株有2个抗原位点突变,且有2个抗原位点突变的都是2011年分离株.糖基化位点、二硫键和受体结合位点都没有发生改变.5株苏州株和各地的分离株都表现出按年份聚类的特点.结论 详细分析了苏州地区新型H1N1流感病毒HA的分子特征,表明苏州毒株的抗原位点上出现氨基酸残基的变化,但仍处于稳态.

关键词：流感病毒A型、血凝素类、病毒、遗传学、微生物

所属期刊栏目：26

分类号：R511.7(传染病)

资助基金：江苏省预防医学课题Y201023;苏州市科教兴卫课题SWKQ1032

在线出版日期：2012-11-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：266-269