海南岛两株甲病毒基因组3＇末端核苷酸序列的克隆与分析

摘要：

目的　从分子水平鉴定海南省分离的两株甲病毒(HBb17和M1病毒)。方法　采用RT-PCR方法　，分别扩增两株病毒基因组的3＇末端核苷酸序列，扩增产物经亚克隆，筛选重组子并测定核苷酸序列对序列进行分析。结果　HBb17和M1病毒分别扩增出约1.6kb和1.3kb的特异片段。序列分析表明，在3＇末端非翻译区HBb17病毒与罗斯河病毒(国际标准株T48病毒)核苷酸同源性为99％，M1病毒与鹭山病毒(SAG)同源性为98％；两病毒结构基因的E1区序列，HBb17病毒与罗斯河病毒核苷酸(氨基酸)同源性为99％(99％)，M1病毒与鹭山病毒核苷酸(氨基酸)同源性为97％(99％)，M1病毒与盖塔病毒同源性为94％(98％)。结论　序列分析表明，海南岛分离的HBb17病毒属于罗斯河病毒，M1病毒可能是鹭山病毒或盖塔病毒的变异株。

关键词：甲病毒属、罗斯河病毒、鹭山病毒、克隆、分子生物学、碱基序列

所属期刊栏目：14

分类号：R3(基础医学)

资助基金：国家自然科学基金39823002

在线出版日期：2004-03-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：213-217