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10.3760/cma.j.cn112050-20200421-00251

环状RNA的筛选及其表达在儿童脑性瘫痪诊治中的意义

引用
目的:分析环状RNA在脑性瘫痪(简称脑瘫)患儿中的差异表达情况,从而探讨其成为脑瘫早期诊断标志物的可能性。方法:回顾性分析2017年6月至2018年10月在新疆医科大学第二附属医院神经外科确诊的5例脑瘫患儿的临床资料。同时选取性别、年龄、民族匹配的5名健康儿童,收集其外周血,采用芯片技术检测环状RNA在脑瘫患儿中的表达谱,两组间环状RNA的差异表达水平比较采用独立样本 t检验。通过基因本体富集分析法和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析法对差异表达的环状RNA进行分析,探讨环状RNA的生物学功能与基因功能改变和细胞通路的关系。同期随机选择20例脑瘫患儿(脑瘫组)和20名健康儿童(健康组),并收集其外周血,对表达具有明显差异的环状RNA采用定量实时聚合酶链反应(qRT-PCR)技术进一步验证。 结果:在5例脑瘫患儿和5名健康儿童中共发现53 586个不同表达的环状RNA,共筛选出45个差异表达的环状RNA,其中表达上调的43个,表达下调的2个(差异倍数≥2.0, P<0.05)。基因本体富集分析发现,环状RNA的生物学功能与神经发生、神经元分化、发育过程的调节、细胞周期调控等有关。KEGG富集分析发现,环状RNA可能与cAMP信号通路、内质网蛋白质加工、调节干细胞多能性的信号通路等相关。筛选并验证3个环状RNA的结果表明,hsa_circ_0062733(差异倍数=3.20, P=0.010)在qRT-PCR验证时具有良好的特异性。 结论:脑瘫患儿较健康儿童存在大量差异表达的环状RNA,经验证hsa_circ_006273在脑瘫患儿中差异表达显著且表达上调,hsa_circ_006273可能成为脑瘫早期诊断的潜在生物学标志物。

脑性瘫痪、基因表达、环状RNA、微阵列芯片

37

新疆维吾尔自治区自然科学基金青年基金2017D01C255;Xinjiang Uygur Autonomous Region Natural Science Foundation Youth Fund Project2017D01C255

2023-05-30(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

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