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摘要: 目的:分析造血系细胞特异蛋白1(HCLS1)基因在脑胶质瘤中的表达特征及其意义。方法:收集中国脑胶质瘤基因组图谱(CGGA)计划数据库的两套mRNA测序数据及其临床资料(CGGA325数据集325例,CGGA693数据集693例)。分析
HCLS1在不同世界卫生组织(WHO)病理学分级、异柠檬酸脱氢酶(
IDH)突变状态、2016年中枢神经系统肿瘤分类、O
6-甲基鸟嘌呤DNA甲基转移酶(
MGMT)启动子甲基化状态的脑胶质瘤患者中的表达特征。根据
HCLS1表达量的中位数,将患者分为高表达组和低表达组,绘制Kaplan-Meier生存曲线,采用log-rank检验比较不同
HCLS1表达水平患者的生存差异。采用单因素和多因素Cox回归分析判断脑胶质瘤患者总生存期的影响因素。收集2007年1月至2015年10月首都医科大学附属北京天坛医院神经外科收治的脑胶质瘤患者的脑胶质瘤样本和生存信息(实验组1共27例,实验组2共17例),实验组1采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测
HCLS1的表达量,实验组2采用免疫组织化学染色检测HCLS1蛋白的表达情况,并计算免疫组织化学染色评分。采用生物信息学方法分析
HCLS1的生物学功能。
结果:在CGGA325数据集中,
HCLS1的表达量随WHO病理学级别(Ⅱ~Ⅳ级)的升高而增加(
F=30.29,
P<0.001);
HCLS1在
IDH野生型中的表达量高于
IDH突变型(
t=8.51,
P<0.001);依据2016年的中枢神经系统肿瘤分类,3组低级别脑胶质瘤患者中,
HCLS1表达量在
IDH突变+1p/19q联合缺失组最低(
F=23.61,
P<0.001),而两组高级别脑胶质瘤患者中,
HCLS1在
IDH野生组的表达高于
IDH突变组(
P<0.001);
MGMT启动子非甲基化者的
HCLS1表达量高于甲基化者(
P=0.001);
HCLS1高表达组患者的总生存期短于低表达组(
P<0.001)。
HCLS1的上述表达特征在CGGA693数据集中得到了验证。多因素Cox回归分析结果显示,
HCLS1表达量是影响脑胶质瘤患者总生存期的独立危险因素(
HR=1.951,95%
CI:1.307~2.910,
P=0.001)。qRT-PCR结果显示,
HCLS1的表达量随WHO病理学级别的升高而增加(
F=11.11,
P<0.001)。免疫组织化学染色评分结果显示,HCLS1蛋白在WHO Ⅱ~Ⅳ级组织样本中的评分依次为(1.33±0.21)分、(3.40±0.87)分及(7.67±0.88)分,组间差异有统计学意义(
F=21.88,
P<0.001)。实验组1和2中,HCLS1基因和蛋白高表达患者的总生存期均短于低表达者(均
P<0.05)。生物信息学分析提示,
HCLS1可能与脑胶质瘤细胞的免疫反应有关。
结论:HCLS1的表达量与脑胶质瘤的恶性程度及患者的生存期有关,可作为判断患者预后的潜在指标。
关键词: 神经胶质瘤、基因、预后、免疫、造血系细胞特异蛋白1
所属期刊栏目: 37
资助基金: 国家自然科学基金81972337;北京市委组织部拔尖人才项目2017000021223ZK32;北京市自然科学基金JQ20030;National Nature Science Foundation of China81972337;Beijing Talents Foundation from Organization Department of Municipal Committee of the CPC2017000021223ZK32;Nature Science Foundation of BeijingJQ20030
在线出版日期: 2023-05-30(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
页数: 共7页
页码: 516-522
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