核糖体结合糖蛋白2在脑胶质瘤中的表达及其在预后评估中的作用

摘要：

目的探 讨核糖体结合糖蛋白2(RPN2)在脑胶质瘤中的表达模式,以及其与患者的临床特征及预后的关系.方法 回顾性分析309例来自中国脑胶质瘤基因组图谱数据库(CGGA)的脑胶质瘤患者的临床资料及其mRNA测序数据,分析RPN2基因的表达模式.对2016-2017年首都医科大学附属北京天坛医院收治的30例脑胶质瘤患者肿瘤样本采用实时荧光定量PCR验证RPN2基因的表达情况.根据RPN2基因的表达水平,将所有样本分为低表达组(154例)和高表达组(155例).以癌症基因组图谱数据库(TCGA)的mRNA测序数据和REMBRANDT的mRNA芯片数据作为独立验证数据集.采用方差分析和t检验分析RPN2基因的表达特征.应用Kaplan-Meier生存曲线、Log-rank检验以及Cox回归分析方法评价RPN2基因在脑胶质瘤患者预后评估中的作用.通过DAVID软件分析RPN2基因参与的GO生物学过程和KEGG信号通路.结果 CGGA mRNA测序数据显示,在世界卫生组织(WHO)Ⅱ、Ⅲ以及Ⅳ级脑胶质瘤中,RPN2的表达水平呈升高趋势(分别为-0.55±0.61、0.05±0.66以及0.36±1.20,P＜0.0001);实时荧光定量PCR也证实,RPN2的表达水平随胶质瘤WHO等级的升高呈逐渐升高的趋势.在TCGA脑胶质瘤的4个分型中,RPN2在神经元型中表达最低,在间质型中表达最高(分别为-0.80±0.56和0.68±1.02,P＜0.001).RPN2在IDH突变型脑胶质瘤中的表达低于其在野生型中的表达(分别为-0.22±0.77和0.22±1.18,P＜0.001).RPN2基因高表达组脑胶质瘤患者的总体生存期小于低表达组(P ＜0.001).RPN2基因的上述特征均在TCGA mRNA测序数据及REMBRANDT mRNA芯片数据集中得到类似的结果.多因素Cox分析显示,RPN2基因的表达水平是脑胶质瘤患者预后的独立预测因子(P=0.004).RPN2基因可能参与脑胶质瘤细胞的凋亡、分裂、增殖、黏附、血管生成等生物学过程.结论 RPN2基因与脑胶质瘤的恶性程度密切相关,可作为判断患者预后的指标及潜在的治疗靶点.

关键词：神经胶质瘤、基因表达谱、预后、核糖体结合糖蛋白2、生物学过程

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资助基金：国家自然科学基金81761168038,81502495,81702460National Natural Science Foundation of China81761168038,81502495,81702460

在线出版日期：2018-12-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1155-1160