基于TP0136蛋白异质性建立一种新的苍白密螺旋体分子分型方法

摘要：

目的:基于苍白密螺旋体属（TP）TP0136蛋白的异质性，建立一种新的TP分子分型方法。方法:从GenBank中查询9株梅毒苍白密螺旋体（TPA）、3株雅司苍白密螺旋体（TPE）、1株未分类的类人猿密螺旋体（FB）和1株地方密螺旋体（TEN）的TP0136开放阅读框（ORF）氨基酸序列并进行多重序列比对，得出TP0136蛋白分子分型结果。利用建立的TP0136蛋白分子分型方法，对2015年1月至2018年12月南方医科大学皮肤病医院收集的23株TPA临床分离株进行分类，并将分型结果与传统的Arp/Tpr/TP0548三基因分型方法进行比较。结果:TP0136蛋白在不同种TP株中具有高度异质性，根据TP0136氨基酸序列，TPE、FB和TEN分为Ⅰ~ Ⅳ 4个亚型，TPA分为Ⅴ~ Ⅹ 6个亚型，TPA临床株分为Ⅶ、Ⅸ、Ⅹ、Ⅺ 4个亚型。通过TPA传统的三基因分型方法可将23株TPA临床株分为13D/d、14D/f、14D/g、15D/f、16A/e 5型。将TP0136分型法与传统分型法相结合，可将上述临床株进一步细分为10型，其中14D/f型应用TP0136分型法可进一步分为3个亚型。结论:TP0136分子分型方法可用于TP种的区分，有助于传统TPA分子分型的进一步完善。

关键词：密螺旋体属、梅毒、基因分型技术、序列分析，蛋白质、TP0136

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在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：546-550