临床分离阿萨希毛孢子菌IGS1区克隆及RFLP分析

摘要：

目的 明确临床分离的5株阿萨希毛孢子菌(T.asahii)基因间隔区(IGS1)的序列,分析T.asahii种内基因多态性.方法 用玻璃珠法分别提取临床分离5株T.asahi及标准对照株总DNA,用ITS及IGS1区特异引物,PCR扩增目的区域,IGS1区扩增产物纯化后进行克隆、测序,测序结果分别提交到基因库,获取登录号.用BLAST和CLUSTAL X 1.83软件对序列进行比对分析.分别用限制性内切酶HapⅡ、MboⅠ、AluⅠ、HhaⅠ对ITS及IGS1区PCR产物进行酶切及RFLP分析.结果 6株菌均成功扩增出长度约为540 bp的ITS区及643 bp的IGS1区基因片段,IGS1区序列相似性为97%～99%.RFLP分析发现,菌株BZP07003 IGS1区HapⅡ酶切结果及菌株BZP07004 IGS1区HhaⅠ酶切结果与其他菌株不同,MboⅠ及AluⅠ酶切6株菌结果无差异,ITS区6株菌酶切结果无差异.结论 T.asabii IGS1区种内存在差异.HhaⅠ及HapⅡ可用于T.asahii种内多态性的分析研究,临床分离5株菌存在3种酶切结果,初步提示T. Asahii临床分离株可能具有种内多态性及遗传差异.

关键词：毛孢子菌属、序列分析、DNA、多态性、限制性片段长度

所属期刊栏目：41

分类号：Q944.58;S603.2;R394

资助基金：国家自然科学基金30570099

在线出版日期：2008-09-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：512-514