蓖麻油体蛋白基因家族鉴定和盐碱胁迫响应分析

摘要：

本研究以蓖麻为对象,利用生物信息学手段对蓖麻Oleosin基因家族进行全面鉴定分析,得到5个Oleosin基因家族成员,序列长度在138～232 aa之间;分子量在14.484 93～25.42461 kDa之间;等电点介于9.07～10.96之间;均为疏水性蛋白且具有高度保守的"脯氨酸结";α-螺旋和无规则卷曲是蓖麻Oleosin蛋白的主要组成结构;基序分析显示,Motif1～Motif4存在所有蓖麻Oleosin蛋白中.编码这些蛋白的5个Oleosin基因分布于4条染色体上,在进化关系上被划分到U-Oleosin、SL-Oleosin和SH-Oleosin三个亚族;基因结构分析显示,除RcOleosin2有一个内含子外,其余RcOleosin基因均无内含子;5个基因启动子区域均存在多种与逆境响应相关的顺式作用元件;共线性分析显示,基因组多倍化不是蓖麻Oleosin基因家族扩张的主要原因;盐碱胁迫下的蓖麻种子转录组数据表明,5个Oleosin基因均在盐碱胁迫过程中有一定的调节功能.

关键词：蓖麻、油体蛋白、基因家族、生物信息学

所属期刊栏目：43

分类号：S565.6(经济作物)

资助基金：山西农业大学校科技创新提升工程项目CXGC2023027

在线出版日期：2024-09-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：103-111