云南栘[木衣]WOX基因家族的鉴定与表达分析

摘要：

为探究云南栘[木衣]WOX基因家族成员的功能和表达模式,本研究通过生物信息学方法对云南栘[木衣]WOX基因进行全基因组鉴定.结果表明,云南栘[木衣]基因组中共有20个DdeWOX基因,且不均匀地分布在12条染色体上;家族成员的长度在176～877个氨基酸之间,含有2～9个内含子,编码17～50个氨基酸;系统进化结果显示DdeWOX基因可分为3个进化分支.分析4个果实发育时期及5个种子萌发阶段的转录组数据,并从中随机挑选6个基因进行RT-qPCR测定以验证转录组的整体准确性.发现DdeWOX13a/DdeWOX11在果实发育的不同时期内具有较高表达量,推测这两个基因可能参与云南栘[木衣]的果实发育过程,且二者可能存在功能冗余;另外DdeWOX2在种子萌发的成苗期内具有较高表达,推测其可能参与调控种子萌发过程;值得注意的是DdeWOX13a在种子萌发阶段也有较高表达,推测该基因可能同时对种子萌发及果实发育具有调控作用.

关键词：云南栘[木衣]、WOX基因家族、生物信息学、表达分析

所属期刊栏目：43

分类号：S792.99(森林树种)

资助基金：国家自然科学基金;云南省万人计划

在线出版日期：2024-09-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：36-45