水稻温敏型叶色突变体tsa58的变异检测及转录组分析

摘要：

利用60Co辐射诱变贵州地方粳稻种质资源"桥港珍珠米",筛选获得一个温敏型叶色突变体tsa58(temperature-sensitive albino 58),该突变体在 20℃和 30℃条件下培养,幼苗存在显著的叶色差异.在 20℃条件下,tsa58 叶片呈现完全白化;在 30℃条件下,tsa58 叶色与野生型无明显差异.在 20℃条件下,与野生型相比,tsa58 叶片的总叶绿素、叶绿素a、叶绿素b和类胡萝卜素含量降低幅度最大,均达到极显著差异水平;在 30℃条件下,与野生型相比,tsa58 叶片的总叶绿素、叶绿素 a、叶绿素 b和类胡萝卜素含量均与野生型无显著差异.为了明确该突变表型的候选基因,采用二代高通量测序技术对突变体tsa58 和野生型进行全基因组变异分析.研究发现,在定位区间内的 20878044～21473236 间发生了INV(倒置)结构变异,其位点 21473236 位于Os02g0565400 的外显子上.转录组分析结果表明,该基因在野生型中存在TSS、TTS、AE等 3 种剪接类型,并存在 5 个不同的剪接位点,而突变体tsa58 未检测到可变剪接.由于该 INV变异导致该基因的可变剪接类型发生变化,因此推测tsa58 为Os02g0565400(WSL4)的新等位突变体.转录组差异基因分析表明,突变体tsa58 与野生型的差异基因在核糖体最多,为 27 个,其中由叶绿体基因组编码的基因rps7、rpl32、rpl20 和rps16 均显著下调,而由细胞核基因组编码的基因中除OsRPL44 显著下调外,其余基因均显著上调.

关键词：水稻、温敏型叶色突变体、变异检测、转录组分析、辐射诱变

所属期刊栏目：42

分类号：S511(禾谷类作物)

资助基金：贵州省自然科学基金项目;贵州省科技支撑计划项目;贵州省科技支撑计划项目;贵州省科技计划项目

在线出版日期：2023-08-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1-8