鼠曲草叶绿体全基因组特征及系统发育分析

摘要：

采用Illumina平台对鼠曲草的叶绿体全基因组进行测序.结果表明,鼠曲草的叶绿体基因组大小为 153103 bp,该叶绿体基因组包含一对 24765 bp的反向重复区域,每个区域分隔一个 18509 bp的小单拷贝区域和一个 85064 bp 的大单拷贝区域,总 GC含量为 37.1％;共注释得到 113 个独特基因,包含蛋白质编码基因 80 个、rRNA基因 4 个和 tRNA基因 29 个;共鉴定出 48 个散在重复序列和 74 个简单重复序列;偏好使用 A/U 结尾的密码子.系统发育分析表明,鼠曲草与香青、蜡菊和火绒草的亲缘关系最近.鼠曲草叶绿体全基因组分析为鼠曲草物种鉴定、保护及开发利用、系统发育的研究奠定了基础.

关键词：鼠曲草、叶绿体基因组、重复序列、密码子偏好性、系统发育分析

所属期刊栏目：42

分类号：S567.21+9(经济作物)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;国家自然科学基金

在线出版日期：2023-06-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：30-37