玉米灰斑病病原菌胁迫下玉米转录组测序的SNP和InDel分析

摘要：

为探究抗、感灰斑病玉米自交系的遗传性差异,对病原菌胁迫下玉米自交系T 32(抗)和J 51(感)的转录组数据进行单核苷酸多态性(SNP)和插入缺失(InDel)分析.结果表明,在17499条Unigene上检测到109977个SNP位点,平均每条Unigene上约有6.3个SNP,每间隔585 bp出现1个SNP,SNP转换类型和颠换类型占比分别为64.88％、35.12％;在11346条Unigene上分析出29849个InDel位点,InDel在每条Unigene上的出现频率为48％,长度1～3 bp占比78％～82％.GO和KEGG功能分类分析结果表明,差异表达基因富集在细胞过程、代谢过程、细胞、细胞部分、黏合和催化活性等.同时差异表达基因最显著富集在运输和分解代谢、信号转导、全局和概览图、翻译、折叠、分类和降解、环境适应等通路途径.

关键词：玉米、灰斑病、转录组、SNP标记、InDel标记

所属期刊栏目：42

分类号：S513(禾谷类作物)

资助基金：贵州省科技计划项目;国家自然科学基金

在线出版日期：2023-05-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1-8