贵州平塘黑糯稻半矮秆突变体bgsd-2苗期与抽穗期转录组比较分析

摘要：

株高是水稻重要的农艺性状,与产量和品质密切相关.突变体bgsd-2在抽穗期与野生型平塘黑糯相比,表现出明显矮化,但是苗期株高没有显著差异.本研究在前期PTWT和bgsd-2抽穗期转录组数据的基础之上,进一步比较分析了PTWT和bgsd-2苗期和抽穗期两个发育阶段差异基因的动态变化.从4个比较组(PTWT-L与PTWT-F、bgsd-2-L与bgsd-2-F、PTWT-L与bgsd-2-L、PTWT-F与bgsd-2-F)中分别鉴定得到3984、3533、2107、1082个差异基因.KEGG分析发现,水稻苗期到抽穗期转变过程中,氨基酸的生物合成、淀粉和蔗糖代谢、碳代谢和核糖体等途径起重要作用.KEGG富集显示,bgsd-2突变位点可能直接影响苯丙烷生物合成和苯丙氨酸代谢两条途径相关基因表达.进一步分析不同比较组中差异转录因子变化的数量和类别,筛选到多个可能在bgsd-2从苗期到抽穗期转变过程中起作用的转录因子.

关键词：平塘黑糯、半矮秆、bgsd-2、转录组测序、发育时期

所属期刊栏目：42

分类号：S511;Q812(禾谷类作物)

资助基金：贵州省科学技术基金;国家自然科学基金

在线出版日期：2023-03-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：7-12,44