怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A基因克隆和功能分析

摘要：

通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因,并采用生物信息学方法、转基因瞬时表达和实时定量PCR进行序列分析、亚细胞定位和器官表达分析.结果表明,怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因cDNA总长度为858 bp,G+C含量为49.53％;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A由285个氨基酸组成,分子量31 437.53 Da,等电点5.77,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(28.77％)、β-片层(16.14％)、无规则卷曲(55.09％)构成;三级结构为单体;预测怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A主要存在细胞核、线粒体、叶绿体和细胞质中;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A在进化上与硬粒小麦、节节麦、乌拉尔图小麦、大麦、二穗短柄草的亲缘关系较近,尤其是与硬粒小麦未命名蛋白产物(VAH 15508.1)在进化上具有最高的亲缘关系.通过烟草叶片亚细胞定位分析表明,烟草病毒增殖蛋白2 A定位于细胞质和细胞核中.实时定量PCR结果显示,烟草病毒增殖蛋白2 A基因在怀玉山三叶青2个栽培种中的表达存在器官特异性,怀玉2号和怀玉1号均在叶中表达量最高.

关键词：怀玉山三叶青、烟草病毒增殖蛋白2 A、基因克隆、亚细胞定位、表达分析

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分类号：S572

资助基金：国家自然科学基金;江西省科技厅重点研发计划一般项目;江西省科技厅重点研发计划一般项目;江西省教育厅科学技术研究项目;上饶市科技局重点研发计划一般项目;上饶市科技局平台载体建设项目;上饶市科技局平台载体建设项目

在线出版日期：2022-05-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：45-51