滇白前种子转录组测序及功能注释

摘要：

采用高通量测序技术平台Illumina Novaseq 6000对滇白前种子进行转录组测序,共获得平均长度为753.9 bp的43663个Unigenes.注释到六大功能数据库(NR,COG,Pfam,Swiss-Prot,GO,KEGG)上的Unigene总数为29177个.滇白前Unigenes比对到NR数据库共有26688条,与甜菜、藜麦、栓皮栎、菠菜有较高同源性;25657条Unigenes在COG数据库得到26500个注释,分为23类;19942条Unigenes在GO数据库得到79481个注释,按功能分为细胞组分、分子功能和生物过程三大类,分别有13、16、23个亚类,其中参与的生物过程较多;11527条Unigene富集在KEGG数据库的101条代谢通路中,代谢相关的通路占比最大.同时,有527个Unigenes被注释为转录因子;有3995条SSR标记被挖掘.利用高通量测序获得滇白前转录组信息,有助于从分子水平对滇白前进行深入研究.

关键词：滇白前、种子、转录组、测序、基因功能注释

所属期刊栏目：40

分类号：Q812(生物工程学(生物技术))

资助基金：云南省教育厅科学研究基金项目;云南省高校优势特色重点学科生态学建设项目;西南林业大学科研预研基金

在线出版日期：2021-04-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：52-59