贵州山核桃转录组文库构建与测序

摘要：

为探讨贵州山核桃(Carya cathayensis Sarg.)转录组功能基因信息,首次使用Illumina Hiseq 2500平台对贵州山核桃进行转录组测序分析,共获得43241968个reads片段.经序列组装共计获得98117条unigene,总长度高达80841463 bp,74.22％的unigene长度集中在1～1000 bp之间.功能注释结果显示,有58464个unigene在NR数据库获得注释,注释到葡萄科的占总的unigene 28.7％.另外对获得注释的序列信息进行初步分析,选取生物学特征重要基因(生长相关基因)和油脂合成相关基因进行初步筛查,分别获得15个和16个基因,填补了贵州山核桃转录组功能基因信息空白,为进一步开展贵州山核桃重要品质基因挖掘和功能标记开发奠定了重要的分子基础.

关键词：贵州山核桃、转录组、构建、测序

所属期刊栏目：40

分类号：S664.1(果树园艺)

资助基金：贵州省教育厅青年科技人才成长项目"贵州山核桃微卫星SSR;单核苷酸多态性;贵州省科技计划项目"贵州山核桃油脂合成相关基因的克隆与表达"

在线出版日期：2021-04-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：91-95