高粱非编码区SSR引物设计以及e-PCR的验证

摘要：

本研究通过在NCBI公共数据库的高粱全基因序列中进行简单重复序列SSR搜索,结果显示共有87950个SSR位点,共有1134种重复,其中二元碱基和三元碱基重复所占比例最大,分别占43.36%,32.38%.根据SSR搜索结果设计了高粱SSR引物,通过两次e-PCR验证和筛选引物,随机合成了50对引物.以先锋和乐食两个高丹草品种为材料进行引物的筛选和评价.结果表明,50对引物中有46对引物出带,但只有8对引物具有多态性.这说明在高粱非编码区设计的引物多态性并不高于EST-SSR引物,但对高粱的SSR引物的开发可以起到补充和促进作用.

关键词：高粱、非编码区、SSR、e-PCR、多态性

所属期刊栏目：29

分类号：S514(禾谷类作物)

资助基金：国家自然科学基金31071470;科技部农业科技成果转化资金项目2008 GB 2 C 300125;安徽省"115"产业创新团队资助皖人才办[2009]2号;国家科技支撑计划项目2008 BADB 3 B 10;安徽省高校学科拔尖人才基金教秘人[2005]79号;安徽科技学院稳定人才专项ZRC 2009236

在线出版日期：2011-01-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1-6,12