非小细胞肺癌环状RNA表达谱的差异分析

摘要：

目的 探讨环状RNA(circularRNA,circRNA)在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)癌组织及对应癌旁组织中表达谱的变化,并分析二者的差异.方法 应用高通量circRNA芯片技术筛选3例患者NSCLC癌组织及对应癌旁组织中circRNA表达谱的差异,经过对原始数据进行预处理、归一化后,筛选出差异表达的circRNA,并对其进行聚类分析和生物信息学预测.结果 芯片检测结果显示circRNA在以上组织标本中表达分布几乎是相同的;层次聚类分析、散点图和火山图结果显示差异表达的circRNA能将NSCLC癌组织与癌旁组织明显区分开来.NSCLC癌组织与癌旁组织之间存在171种circRNA的差异表达,其中在肿瘤组织中高表达的有148种,低表达的有23种(变化＞2倍且P＜0.05).应用TargetScan和miRanda软件预测出每种差异circRNA结合匹配值较高的5个微小RNA(micmRNA,miRNA),提示包括miR-21、miR-22、miR-29、miR-129、miR-143、miR-150和miR-200等均为在NSCLC发生发展中起着重要调控作用的miRNA.结论 NSCLC癌组织与对应癌旁组织比较,circRNA表达谱发生了显著变化,这些差异表达的circRNA可能与非小细胞肺癌的发生发展密切相关.

关键词：非小细胞肺癌、环状RNA、环状RNA芯片

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分类号：R734.2(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金资助项目81500332北京市卫生系统高层次卫生技术人才培养项目2015-3-052

在线出版日期：2018-06-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：144-149