非小细胞肺癌放疗敏感性miRNAs的生物信息学筛选

摘要：

目的 利用基因芯片及生物信息学方法预测与非小细胞肺癌(NSCLC)放疗敏感性相关的miRNAs.方法 检索GEO数据库,获取H460、H1299细胞株经2Gy电离辐射后随时间变化的基因表达谱,经组织特异性分析、功能富集(GO)分析、信号转导通路(Pathway)分析、miRNAs预测分析、转录因子(TF)分析,并建立mRNA-miRNA-TF网络,获取NSCLC放疗敏感性相关的miRNAs.结果 获得了NSCLC放疗敏感性基因表达谱,辐射抵抗潜在基因共23个,辐射敏感潜在基因共97个;与放疗敏感性相关的miRNAs共19个,其中调控辐射抵抗组的miRNAs共14个:hsa-miR-1-3p、hsa-miR-1297、hsa-miR-153-3p、hsa-miR-193a-3p、hsa-miR-206、hsa-miR-302e、hsa-miR-328-3p、hsa-miR-372-3p、hsa-miR-495-3p、hsa-miR-520a-3p、hsa-miR-520b、hsa-miR-520d-3p、hsa-miR-520e、hsa-miR-613;调控辐射敏感组的miRNAs共5个:hsa-let-7c-5p、hsa-miR-137、hsa-miR-203a-3p、hsa-miR-34c-5p、hsa-miR-98-5p.结论 利用生物信息学方法初步筛选到与非小细胞肺癌放疗敏感性相关的miRNAs.

关键词：非小细胞肺癌、基因芯片、生物信息学、放疗敏感性、miRNAs

所属期刊栏目：9

分类号：R734.2(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金资助项目81272496重庆市自然科学基金资助项目cstc2012jjB10003,cstc2012jjA10096

在线出版日期：2016-08-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：131-134