基因组选择信号揭示西×荷杂交牛杂种优势相关基因

摘要：

为探究德系西门塔尔牛与荷斯坦牛的杂种优势,挖掘与杂种优势相关的候选基因,解析牛杂种优势的遗传机制.该研究选择系谱信息清晰的德系西门塔尔牛(父本)、荷斯坦牛(母本)及其杂交F1代共91头个体,利用Illumina Bovine GGP100K高密度芯片进行基因分型,基于群体分化系数Fst对其开展研究,鉴定杂种优势相关基因.结果表明,F1代与德系西门塔尔牛(父本)Fst分析发现,在全基因组水平Top 1％的阈值内,检测到859个SNPs位点区域Fst值＞0.19,注释到候选基因249个;与荷斯坦牛(母本)的Fst分析,发现有860个SNPs位点区域Fst值＞0.15,注释到261个候选基因.基因Pathway富集分析发现,F1代与父本间受到选择的基因主要富集在轴突引导通路(P＜0.01);与母本间受到选择的基因主要富集在灶性粘连和催乳素信号通路(P＜0.05),这些通路上的基因可能对杂交后代杂种优势的产生具有较大的影响.对F1代与父本、母本共同受到选择的SNPs位点进行定位与注释,鉴定发现共有38个与牛生长发育、产奶、肉质、胴体、繁殖等性状相关的基因,如OXTR、CHKA、PRKN等.结果表明这些基因可能为西×荷杂交牛杂种优势相关基因,并为西荷杂种优势利用提供了参考依据.

关键词：全基因组、选择信号、杂种优势

所属期刊栏目：19

分类号：S828.2;S609.3;S513

资助基金：国家重点研发计划;国家自然科学基金;中国农业科学院创新工程

在线出版日期：2023-08-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：9-18