转录组分析松茸多糖诱导T细胞增殖的分子机制

摘要：

目的 转录组分析松茸多糖(TMP-A)诱导T细胞增殖的分子机制.方法 分别用TMP-A(10 μg/mL)、LPS(10 μg/mL)处理T细胞24h,采用RNA-seq测序技术对T细胞进行测序并进行生物信息学分析.结果 空白对照组、TMP-A组和LPS阳性对照组分别得到46 574 489、50 259 600、57 439 600条Clean reads,对应的总大小分别为6.99、7.54、8.62G.线粒体色素C氧化酶基因家族、钙网蛋白基因等是TMP-A组的超高表达基因,在T细胞增殖过程中细胞运动、蛋白质合成及线粒体代谢增强,且氧化磷酸化所产生的能量是T细胞增殖过程的主要能量来源.TMP-A组相比于空白对照组有485个基因差异表达,其中上调的基因482个,下调的基因3个,主要与离子转运和系统过程,外周和质膜以及分子功能中转运活性有关;且通路涉及神经活性配体-受体相互作用、Ras信号途径、MAPK信号途径等.结论 T细胞在TMP-A作用下的生物代谢发生差异,离子转运、质膜、转运活性相关基因是TMP-A诱导T细胞增殖的关键基因,且Ras-Raf-Erk-MAPK信号通路是TMP-A诱导T细胞增殖的关键信号通路.

关键词：松茸多糖、RNA-Seq测序、差异基因、Ras-Raf-Erk-MAPK信号通路

所属期刊栏目：42

分类号：R285.5(中药学)

资助基金：四川省科技厅应用基础重点项目;四川省科技厅重点研发项目;四川省教育厅重大培育项目;南充市科技局项目

在线出版日期：2020-08-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1738-1747